內蒙古有1所大學入選第二輪雙一流建設高校，那就是內蒙古大學，所以內蒙古大學是雙一流大學，不過只有1個雙一流建設學科。
| 序號 | 學科名稱 |
| 1 | 生物學 |
就業方向：農、林、牧、漁類企業：生物研究、生物技術、生產管理、技術開發；醫藥類企業：生物工程、生物制藥、生化實驗；教育類企業：生物教師、生物產品教研等等。
畢業生考研時可選擇的專業方向：生物化學與分子生物學、植物學、細胞生物學、遺傳學、學科教學（生物）、生物科學、生物技術和生態學以及醫學、農業學科等領域。
| 序號 | 學校名稱 | 學科名稱 | 評估結果 |
| 1 | 內蒙古大學 | 民族學 | B |
| 2 | 內蒙古大學 | 中國語言文學 | B |
| 3 | 內蒙古大學 | 生物學 | B |
| 4 | 內蒙古大學 | 生態學 | B |
| 5 | 內蒙古大學 | 馬克思主義理論 | B- |
| 6 | 內蒙古大學 | 數學 | B- |
| 7 | 內蒙古大學 | 物理學 | B- |
| 8 | 內蒙古大學 | 化學 | B- |
| 9 | 內蒙古大學 | 計算機科學與技術 | B- |
| 10 | 內蒙古大學 | 法學 | C+ |
| 11 | 內蒙古大學 | 中國史 | C+ |
| 12 | 內蒙古大學 | 應用經濟學 | C |
| 13 | 內蒙古大學 | 外國語言文學 | C- |
| 14 | 內蒙古大學 | 環境科學與工程 | C- |
| 15 | 內蒙古大學 | 軟件工程 | C- |
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內蒙古工業大學有新城校區、金川校區、準格爾校區3個校區，占地面積3228畝，學校設有22個教學單位，擁有62個研究院(所)。
內蒙古農業大學有3個校區，分別是呼和浩特市校區、職業技術學院校區和海流圖科技園區。學校總占地面積1000公頃，其中教學科研用地600余公頃。
內蒙古師范大學位于內蒙古自治區呼和浩特市，是新中國成立后在邊疆少數民族地區最早建立的綜合性師范大學，為自治區重點大學。
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